微创介入科是医院的重点科室，是以肿瘤介入治疗为主的综合介入治疗科室，现有床位42张，主要开展放射介入、超声介入、物理消融、化学消融以及组织间放疗等特色治疗，是全国微创技术培训示范基地、美国ENDOCARE公司氩氦刀临床培训基地、全国的3D打印模版引导放射性粒子植入技术培训基地。
以冯铁虹主任医师为学科带头人的团队，开展肿瘤介入治疗20多年，先后为16000多名患者进行了特色有效的治疗。早在1995年就率先利用数字胃肠机开展了肿瘤介入治疗工作，奠定了我院肿瘤介入的基础。1996年肝癌介入治疗获呼和浩特铁路局技术进步奖。2001年团队在内蒙古地区率先开展放射性粒子植入治疗肿瘤。特别是2009年成立微创介入科以来，在内蒙古自治区率先引进美国四代氩氦刀、德国生产大型C臂数字减影X光机、日本进口彩色超声机、日本直肠阴道B超机、射频消融治疗仪、体腔热灌注、介入热灌注、体外高频热疗仪、免疫增强治疗仪、微波治疗仪、高能超声聚焦刀、放射性粒子治疗计划系统等先进特色设备，同时特别重视团队人才的培养，先后组织20多名团队成员到北京肿瘤医院、天津肿瘤医院、广州肿瘤医院等国内一流的肿瘤医院进修学习，进一步提升了团队成员的岗位胜任力，副主任医师白喜玲、王磊和主治医师李巍、那顺孟和等成为团队的技术骨干，团队的治疗水平和服务能力显著提高，每年收治肿瘤患者1500多名，其中微创介入特色治疗1000多人。