东方医院特色学科之一，上海市消化动力学组副组长，浦东新区消化动力学组组长单位。胃肠科以“内外联合、综合诊治、胃肠微创、共创卓越”为学科特色。 临床特色鲜明，内外各有特色，同时加以内外联合治疗，主要开展：功能性胃肠疾病诊治，重症炎症性肠病（克罗恩病、溃疡性结肠炎）的内外科联合诊治，胃肠道微创手术：如腹腔镜辅助胃癌根治术、结肠癌根治术、腹腔镜胃穿孔修补术、阑尾切除术、单孔腹腔镜结肠息肉切除术、阑尾切除术、胃部肿瘤切除术，腹膜、肠系膜、腹膜后巨大肿瘤的切除术，胃肠道疾病的内镜诊治。 科室拥有胶囊内镜，胃肠功能检查及生物反馈治疗，胃肠动脉起搏治疗，ESD，腹腔镜，超声刀等先进临床诊治技术。2012年起与瑞士巴塞尔大学外科研究与医院管理研究所（ICFS）建立的合作伙伴关系。学科梯队合理、基础扎实，专科特色彰显、学术氛围浓厚。科室现有正高5名，博士研究生导师4名。
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